Ligase

Définitions de « ligase »

Ligase - Nom commun

• (Biochimie) Enzyme catalysant l'union de deux molécules.

  La ligase est utilisée pour reconstituer une molécule unique d’ADN à partir de fragments de restriction.

Étymologie de « ligase »

Évolution historique de l’usage du mot « ligase » depuis 1800

Synonymes de « ligase »

• liasse

Citations contenant le mot « ligase »

• Co-fondé par Rajesh Chopra, MD, et Ian Collins, PhD, qui sont des leaders éminents dans le domaine de la dégradation des protéines, Monte Rosa a développé une plateforme pour concevoir rationnellement de petites molécules qui reprogramment les ligases ubiquitines afin d’éliminer les vecteurs de maladies auparavant jugés indéfendables. La plateforme comprend des capacités de calcul pour prédire et modéliser les interactions ligase-néosubstrat et la protéomique quantitative pour obtenir des profils de dégradation des protéines.

• ADN ligase d’E. Coli, ADN ligase T4, Ligases de mammifères, Ligases thermostables

• Monoubiquitination of histone H2B-K120/123 plays several roles in regulating transcription, DNA replication and the DNA damage response. The structure of a nucleosome in complex with the dimeric RING E3 ligase Bre1 reveals that one RING domain binds to the nucleosome acidic patch, where it can position the E2 ubiquitin conjugating enzyme Rad6, while the other RING domain contacts the DNA. Comparisons with H2A-specific E3 ligases suggest a general mechanism of tuning histone specificity via the non-E2-binding RING domain.

• Goff, N. J. et al. Catalytically inactive DNA ligase IV promotes DNA repair in living cells. Nucleic Acids Res gkac913. https://doi.org/10.1093/nar/gkac913 (2022).

• HeLa cells, displaying a functional cGAS–STING pathway, were used for most of the experiments. U2OS cells, expressing cGAS, were used to independently validate hits obtained from the siRNA screen. HEK293T cells were used for immunoprecipitation and ubiquitylation studies using transiently expressed tagged constructs. BJ-5ta cells, THP-1 cells and primary endothelial cells were used to ascertain the relevance of cGAS nuclear degradation by the CRL5–SPSB3 ubiquitin ligase across distinct cell types and primary human cells. Cell lines were repeatedly tested for mycoplasma by PCR. No method of cell line authentication was used.

• Peter, J. J. et al. A non-canonical scaffold-type E3 ligase complex mediates protein UFMylation. EMBO J. 41, e111015 (2022).

• a Distribution of the number of categories of ligands identified for each E3 ligase from multiple data sources. b Chord chart for E3 ligases with 3 types of ligands. c Circular barplot representing the distribution of unique ligands of E3 ligases. d E3 ligases with top number of unique ligands and one dot representing 1000 ligands. E3 ligases in red were proceeded to PROTAC clinical trials. E3 ligases in blue were explored in PROTAC experiment.

Traductions du mot « ligase »

Sources et ressources complémentaires

• Définitions du Wiktionnaire
• Synonymes de ligase sur lebonsynonyme.fr